Первоначальная церковь была освящена здесь 20 января 1873 года. Вскоре после этого ей были пожертвованы иконы "Покаяние Марии Египетской" и "Раскаяние блудного сына" работы художника Л. Игорева.
В 1906 - 1911 гг. по проекту гражданского инженера Г. Д. Гримма для церкви Святого Алексия и Дома милосердия было построено новое каменное здание, в котором престол церкви был вновь освящен в 1907 году. Храм был одним из лучших образцов неорусского стиля. В его суровом облике отразился сам дух северных русских храмов, сама их сдержанная, аскетическая природа. К 1911 г. была отделана только верхняя церковь, а нижняя так и осталась без украшения из-за недостатка средств.
В декабре 1932 года церковь была закрыта и затем, в первой половине 30-х годов, здание церкви и Дома милосердия были капитально, до неузнаваемости, перестроены в заводской корпус. Чкаловский просп., д. 50
Источник